A Quaresma é tempo de preparação à Páscoa. Começa na Quarta-feira de Cinzas e vai até a missa da Ceia do Senhor. Assim a sua duração é de 40 dias. Ao longo destes dias fazemos memória dos 40 dias de Jesus no deserto. À luz da experiência de Jesus, vivemos este tempo marcados pelo jejum, oração, escuta da Palavra e conversão. Fazemos também a memória dos 40 anos da experiência do povo de Israel no deserto a caminho à Terra Prometida, tendo consciência de que nós somos o povo peregrino na caminhada até a Jerusalém Celeste. 
            A Quaresma possui dupla característica: batismal e penitencial. Batismal, porque desde os primórdios da Igreja era um tempo dedicado à preparação dos catecúmenos para o batismo na Vigília Pascal. Hoje é o tempo que nos prepara a renovarmos os compromissos do nosso Batismo na Vigília Pascal. Por isso também a liturgia da palavra faz constantes referências a esta dimensão. Outra característica é a de penitência. É um convite insistente de Deus à conversão pessoal e comunitária. Esta conversão encontra sua expressão muito concreta da Campanha da Fraternidade. Este ano, somos convidados a fazer esta caminhada iluminados e motivados pelo tema: Fraternidade e segurança pública, com o lema: A paz é fruto da justiça (Is 32,17). Com ela queremos assumir a luta pela paz e pela justiça compreendidas como dom de Deus e co-responsabilidade de todos na busca de sua plenificação, a partir da beleza e do sentido da vida em todas as circunstâncias, e do compromisso ético do amor fraterno.
Principais celebrações do tempo da Quaresma no Santuário (até o Domingo de Ramos):

• Celebração da Quarta-feira de Cinzas com a imposição de cinzas em todas as celebrações. As cinzas são preparadas dos ramos bentos no Domingo de Ramos do ano anterior.
• Durante a celebração da Quarta-feira de Cinzas faremos solene abertura da Campanha da Fraternidade cujo tema é: Fraternidade e Segurança pública e o lema: A paz é fruto da justiça. Este é também o dia de jejum. No final da celebração será feita a entronização do cruzeiro que será colocado no lugar costumeiro de altares ocasionais, na Gruta do Bom Jesus. Na cruz poderá ser colocado o pano roxo. A Equipe de Ambientação pensará na ambientação própria do altar da Cruz. Atividades ligadas com Jubileu Paulino.  
• Cinco domingos e cinco semanas da quaresma, com orações quaresmais próprias para cada domingo e para cada dia da semana.
• No primeiro domingo da Quaresma, às 19h30min teremos a cerimônia da entrada no Catecumenato do grupo dos catecúmenos. Quaresma é o tempo próprio para a última etapa de preparação dos catecúmenos, que deverão ser batizados na Vigília Pascal. 
• No segundo, terceiro e quarto domingo da quaresma teremos outras cerimônias com a participação dos catecúmenos. 
• No quarto domingo (Laetare). A cor das vestes pode ser rósea.
• Em todas as celebrações dominicais e semanais fazer prece especial pelos catecúmenos que se preparam para receber o sacramento do Batismo na Vigília Pascal. 
• Caminhada da Penitência. Todas as quartas-feiras, saindo do Santuário até um determinado local numa das ruas do Centro, do Bairro Nova Brasília e Beira Rio.
• Ofício Divino no Morro. Todos os sábados, às 6 h da manhã. A caminhada sairá da Esplanada, subindo o Morro onde será cantado o Ofício Divino da Quaresma.
• Celebração da Via-sacra. Todas as sextas-feiras da Quaresma, ás 18h30min. A via-sacra saíra de um determinado local (veja a lista abaixo), passando pelas ruas indicadas na direção da Gruta, onde logo em seguida será celebrada a Santa Missa. O percurso da via-sacra será marcado com as estações, se possível em frente das casas onde tem pessoas doentes, idosas ou portadoras de necessidades especiais.A via-sacra será acompanhada de ministros, coroinhas, leitores. A cruz com o pano roxo abrirá sempre a caminhada. As pessoas são convidadas a levar as velas com a proteção de cor roxa. O trajeto das Vias - Sacras: 1º Sexta – feira 27/02/2008 - Iniciando na Praça do Cruzeiro, Av. Duque de Caxias, Praça do Livro, Coronel Avelino Bastos e Praça da Bandeira – Gruta; 2º Sexta – feira 06/03/2008 – Iniciando na Rua do Machado, Rua das Flores, Ipiranga, continuando na Floriano Peixoto – Gruta; 3º Sexta – feira 13/03/2008 – Iniciando na Rua Guanabara, Francisco Magalhães, Travessa Itapoá, Av. Manoel Novais, continuando na Av. Duque de Caxias – Gruta; 4º Sexta – feira 20/03/2008 – Iniciando na Rua Floriano Peixoto, 2ª Travessa do Mercado Velho, Rua Diocleciano – Gruta; 5º Sexta – feira 27/03/2008 – Iniciando na Rua J. J. SEABRA, passando pela Praça Miguel Calmon – Gruta; 6ª Sexta – feira – 03/04/2008 – Iniciando na Rua Conselheiro Luis Viana, 2ª Travessa Conselheiro Luis Viana, Rua Monsenhor Turíbio – Gruta;
• Via-sacra nos bairros Nova Brasília e Beira Rio. Todas as sextas-feiras, saindo da Igreja do Bom Jesus dos Navegantes, às 18 h. Locais:

1º Sexta – feira 27/02/2008: Rua São Domingos, Rua da Liberdade e Rua da Colina; 2º Sexta – feira 06/03/2008: Camelódromo, Rua da Família e Rua da Esperança. Beira Rio; 3º Sexta – feira 13/03/2008: Rua Estácio de Sá, Tv. Mauá, Rua da Marinha e Rua Cabeça do Boi; 4º Sexta – feira 20/03/2008: Tv. Manoel Novais, Rua Tancredo Neves, Rua C e Rua da Alegria. Beira Rio; 5º Sexta – feira 27/03/2008: Rua 6 de Agosto, Rua Novo Correio e Rua do Mangal; 6ª Sexta – feira – 03/04/2008: Rua 7 de Setembro, Rua Independência e Rua do SAAE.

• Celebração da reconciliação com confissão e absolvição geral. Esta celebração será realizada na Terça-feira Santa. Ao longo do tempo da Quaresma haverá possibilidades para a reconciliação individual.
• Vigília eucarística quaresmal no contexto da CF. Todas as quintas-feiras, ás 18h30min na Gruta.
• Dia Nacional da Coleta da Solidariedade. Será realizada no Domingo de Ramos, em todas as celebrações. É o gesto concreto de fraternidade, partilha e solidariedade, feito em âmbito nacional, em todas as comunidades cristãs, paróquias e dioceses. Além desta coleta poderão ser feitos outros gestos concretos da conversão quaresmal. 

É bom saber que:

• A Quaresma requer sobriedade, despojamento, ares do deserto, de recolhimento. Por isso neste tempo não se canta Glória (a não ser nas solenidades e festas), nem Aleluia.  Não se tocam sinos e instrumentos musicais (a não ser se for necessário para acompanhar os cantos).
• Pelo mesmo motivo, a organização do especo litúrgico (celebrativo) será também de sobriedade e despojamento. Não se usam flores nem outros enfeites (a não ser no quarto domingo). A cor deste tempo é roxa, exceto no quarto domingo da Quaresma, que supõe a cor-de-rosa.
• Os cantos são próprios do tempo da Quaresma. O Hino da CF poderá ser cantado depois da homilia ou no louvor após a comunhão.  
• Para expressar mais a índole penitencial, o ato penitencial dentro da missa poderá ser deslocado para depois da homilia. Durante o ato penitencial os fiéis poderão ficar de joelhos. Poderá ser feita também alguma reverência a Cruz, etc.; O abraço da paz poderá ser feito sem o canto, no recolhimento e em silêncio.   
• A cruz processional poderá ser ornada de pano roxo. A procissão inicial poderá ser feita em silêncio. O canto final poderá ser omitido.
• A oração da CF poderá ser feita como última das preces.
• Quando feita a Oração ao Bom Jesus da Lapa, o refrão entre as partes da oração poderá ser da quaresma: Honra, glória, poder e louvor a Jesus, nosso Deus e Senhor!
• Os Catecúmenos receberão uma formação mais aprofundada na semana e bênçãos especiais durante as celebrações dominicais.
• Na Gruta do Bom Jesus será colocada uma grande cruz de madeira para visualizar mais ainda a índole quaresmal do tempo celebrado.
• O fundo do Cristo da Esplanada será de cor roxa. 
• Será feita a apresentação do tema da CF na Esplanada.